もっとも有名なのは誰もが知っているフグ毒（テトロドトキシン）だと思います。この毒、フグが作り出しているわけではなく、食物連鎖によって毒がフグの体内にたまるのではないかといわれています。ですから全てのフグがフグ毒を持っているわけではない様ですし、個体差がある様です。
　しかし素人料理は危険です。絶対やめましょう！　例えばキタマクラ、トラフグの肉は無毒ですが、ちゃんとさばいたつもりでも血や内蔵が残ったりするそうです。また、加熱調理しても毒性はなくならないのでとても危険です。やはりフグが釣れたらリリースしましょう。 また、フグ以外のお魚（動物）もこの毒を持っている場合があるので注意が必要です。

　もともとはカリブ海に生息するシガ[cigua]と呼ばれる巻貝で起こった食中毒のことだったそうです。その後、その巻貝だけではなく、カリブ海でとれた魚介類による食中毒をさす様になり、現在では珊瑚礁 周辺に住む魚によって起こる食中毒の総称として呼ばれている様です。

　サポニンは植物界に多く、起泡性（石鹸の様に持続性の泡を生じる物質）があることから、ラテン語の石鹸を意味するsapoにちなんで付けられた名前です。ペットボトルのお茶を振ってしまうと泡立つのも、お茶の葉にサポニンが含まれるからだそうです。
　このサポニンは動物界では、ヒトデとナマコにしかみられないそうです。しかも、ほとんどの種がサポニンを含んでいます。
●主な事例
　・オーストラリア産ナマコを食べて数人が死亡。
　・ポリネシア産ナマコの体液が皮膚などにかかり炎症。

　熱帯海域から温帯海域に生息するプランクトンが作りだし、それを食べた二枚貝、さらにそれを食べたカニなども有毒化します。
　麻痺性貝毒はサキシトキシンなどで、フグ毒とほぼ同じ働きをする強力な神経毒で、致命率が高いのが特徴です。この毒も、フグ毒と同じで、加熱調理しても毒性はなくならないのと、特効薬はないそうです。
　また、カニは麻痺性貝毒と共にフグ毒や他の毒ももっているものもいるので特に注意が必要です。

※珊瑚礁域に住むカニ類はガザミ以外は食べない方が安全みたいです。

　血液に毒があるので生食は避けた方がいいお魚もいます。 また、ウナギ、アナゴなどは加熱して食べれば大丈夫ですが、血液が目や口、あるいは傷口に入るとさまさまな症状が起こる危険性がありますので、さばく際には注意が必要です。

　背ビレや胸ビレなどに毒腺のある鋭い刺棘を持つ魚のことを刺毒魚といいます。刺毒魚の数は世界で約200種類、日本では約150種類だそうです。
　うっかり触って刺されると、血圧降下、呼吸障害などに陥り、死亡例もあるので注意が必要です。
　もし釣れてしまったらメゴチばさみなどを使って外すか、仕掛けを切ってリリースしましょう。足で踏んで外そうとして靴を貫通 して刺された例もあるそうです。
　また、刺毒魚の特徴として、魚が死んでも毒は消えないので、釣れてしまった場合、堤防などに放置しないでください。知らない人や子供などが触ると大変危険です。夜釣などで釣れるゴンズイなども充分注意してください。
　あと、お魚ではありませんが同じ様に毒のトゲを持ったウミケムシというのもいます。

　歯が鋭く、咬まれると危険なお魚や、エラがするどいので気を付けた方がいいお魚もいます。